雷公山生物资源丰富，已经鉴定的各类生物种类近2000种，其中：植物1390种，动物518种。列入国家珍稀濒危重点保护的动植物有41种，其中：植物有红豆杉、南方红豆杉、钟萼木、异形玉叶金花、秃杉、水青树、马尾树等18种。动物有大鲵、鸳鸯、黑熊、穿山甲、猕猴、藏酋猴、大灵猫、小灵猫等23种，是我国中亚热带一个极为珍贵的物种基因库。尤其是活化石植物――秃杉及秃杉林，起源古老，是第三纪古热带植物区系孑遗种，是目前国内仅有3个天然秃杉群落分布区域中面积最大，保存最完整、原生性强的一处，是中亚热带唯一的天然秃杉林研究基地。

    雷公山自然保护区地处长江水系和珠江水系的分水岭地带，是构成清水江和都柳江主要支流的发源地。雷公山自然保护区丰富的森林植被不仅对黔东南的水源涵养、水土保持、环境改善及生态平衡的维持起着支柱作用，而且对清水江、都柳江两江流域流露量的补给和调节起着重要的作用，也是长江水系和珠江水系水资源的重要维持者。雷公山自然保护区有绚丽多姿的自然风光，古老奇特的民族风情，可歌可泣的英雄史迹，品种繁多的地方特产等，与贵州中西部喀斯特风光形成鲜明对照，极具生态旅游开发潜力。

    雷公山不仅是物种基因库，而且是一座神秘的山。

    雷公山"三绝"

    秃杉：有 "万木之王"、"天然活化石"之誉。它挺拔、高大是躲过第四纪冰川孑遗的珍惜物种，在国家8种一类珍惜保护植物中，秃杉榜上有名。

    "佛光"胜景点，雷公山终年多雾，一年中有雾日300天，气候宜人，即使是最炎热的七月，月均温度也仅为15.8度，这是因地属北亚热带季风温润气候区，又加之雷公山山体高大，带来垂直方向上气候巨大差异的结果，一山分四季，十天不同天，是典型的概括。由于阳光的折射和多云雾的作用，雷公山常在夏、秋之季多佛光胜景，即海市蜃楼幻景。

    雷公山＂天书＂：《雷山县志》载雷公山主峰北侧雷公坪点将坛处有一青石碑，碑高2米，宽1.5米，厚0.2米，其碑面阴刻碑文，文字千百年来无人可识，当地流传有诸葛孔明碑说和秀眉碑说，现残碑收藏在县文物所，存字共28个，成为神秘的雷公山 "天书"。

    雷公山自然保护区是镶嵌在贵州高原上的一颗绿色明珠，是一块集靠科考与生态旅游为一体不可多得的宝地，是贵州东部极具生态旅游开发潜力的处女地，是研究中亚热带森林生态系统、研究秃杉天然群落等的理想基地，深受中外专家学者和游客的青睐。